Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF2Q01130 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRSF2Q01130 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms