Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CDKL1Q00532 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKL1Q00532 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms