Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITPNAQ00169 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms