Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAMQ00059 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms