Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EFNB1P98172 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EFNB1P98172 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms