Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SIM1P81133 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIM1P81133 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIM1P81133 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIM1P81133 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIM1P81133 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SIM1P81133 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SIM1P81133 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms