Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL13RA1P78552 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IL13RA1P78552 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms