Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2IP78347 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IP78347 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms