Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNG7P62955 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms