Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVFRD-1P60508 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVFRD-1P60508 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms