Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTP1P59025 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTP1P59025 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTP1P59025 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP1P59025 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP1P59025 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms