Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL3P58215 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms