Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB25P57735 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB25P57735 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB25P57735 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB25P57735 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB25P57735 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB25P57735 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB25P57735 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB25P57735 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB25P57735 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms