Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSCP56915 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSCP56915 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSCP56915 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSCP56915 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSCP56915 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSCP56915 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSCP56915 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSCP56915 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSCP56915 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms