Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GEMP55040 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GEMP55040 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEMP55040 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEMP55040 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEMP55040 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GEMP55040 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GEMP55040 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEMP55040 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEMP55040 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEMP55040 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEMP55040 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEMP55040 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEMP55040 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEMP55040 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEMP55040 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms