Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EPHB1P54762 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EPHB1P54762 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHB1P54762 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms