Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNB3P54284 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB3P54284 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms