Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBX2P52951 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GBX2P52951 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX2P52951 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX2P52951 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX2P52951 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms