Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST1P52848 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDST1P52848 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST1P52848 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms