Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRCA2P51587 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRCA2P51587 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms