Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VEGFBP49765 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms