Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TTPAP49638 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TTPAP49638 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTPAP49638 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTPAP49638 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTPAP49638 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TTPAP49638 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TTPAP49638 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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