Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GJA8P48165 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GJA8P48165 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJA8P48165 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJA8P48165 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJA8P48165 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJA8P48165 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms