Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME1P48163 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ME1P48163 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME1P48163 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME1P48163 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME1P48163 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME1P48163 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ME1P48163 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ME1P48163 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ME1P48163 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ME1P48163 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ME1P48163 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ME1P48163 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms