Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC1A4P43007 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC1A4P43007 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms