Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MTHFRP42898 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MTHFRP42898 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms