Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 MIC27YNL100W 705 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 MER1YNL210W 813 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 CIN2YPL241C 807 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 KAR4YCL055W 1008 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 GIN4YDR507C 3429 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 PDR1YGL013C 3207 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 SOK1YDR006C 2706 nt2.55□□□□□ -2
UFE1P41834 CIK1YMR198W 1785 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 YJL049WYJL049W 1353 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 ATP16YDL004W 483 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 MFA1YDR461W 111 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 SEC4YFL005W 648 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 UPF3YGR072W 1164 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 RPL14BYHL001W 417 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 CTK2YJL006C 972 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 ASG7YJL170C 630 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 SPR2YOR214C 711 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 ACM1YPL267W 630 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 VTC3YPL019C 2508 nt2.54□□□□□ -2
UFE1P41834 ICR1ICR1 3199 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 SGM1YJR134C 2124 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 BNR1YIL159W 4128 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 COG7YGL005C 840 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 GTR2YGR163W 1026 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 GPX1YKL026C 504 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 RPC25YKL144C 639 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 MGE1YOR232W 687 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 POL30YBR088C 777 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 SRP68YPL243W 1800 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 PFF1YBR074W 2931 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 CWC22YGR278W 1734 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 RIX1YHR197W 2292 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 HRD1YOL013C 1656 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 YDR061WYDR061W 1620 nt2.53□□□□□ -2
UFE1P41834 MET6YER091C 2304 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 CIN1YOR349W 3045 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 TVP15YDR100W 432 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YEL075CYEL075C 369 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YLR400WYLR400W 474 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YNL276CYNL276C 396 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 MPD2YOL088C 834 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SRL1YOR247W 633 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 DPB3YBR278W 606 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 CWH41YGL027C 2502 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 OSW7YFR039C 1533 nt2.52□□□□□ -2.01
UFE1P41834 ITT1YML068W 1395 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 VPS9YML097C 1356 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PSK1YAL017W 4071 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PIG2YIL045W 1617 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 ATC1YDR184C 885 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PEA2YER149C 1263 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SMX2YFL017W-A 234 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YLL037WYLL037W 381 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PEX27YOR193W 1131 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 RFC5YBR087W 1065 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 VPS3YDR495C 3036 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PSY2YNL201C 2577 nt2.51□□□□□ -2.01
UFE1P41834 NSA1YGL111W 1392 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SMT3YDR510W 306 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 THO1YER063W 657 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YFL012WYFL012W 447 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 MIG2YGL209W 1149 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YGR039WYGR039W 312 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 MRPL9YGR220C 810 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YGR293CYGR293C 462 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PAU14YIL176C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PAU1YJL223C 363 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YNL050CYNL050C 813 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YOR283WYOR283W 693 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 DIA2YOR080W 2199 nt2.5□□□□□ -2.01
UFE1P41834 APC5YOR249C 2058 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SIR3YLR442C 2937 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 RSM24YDR175C 960 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YFL015CYFL015C 495 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SPO11YHL022C 1197 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 PSY1YKL076C 384 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SGT1YOR057W 1188 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 snR24snR24 89 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 APD1YBR151W 951 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YBR287WYBR287W 1284 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 IRC3YDR332W 2070 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 SLN1YIL147C 3663 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 ISW1YBR245C 3390 nt2.49□□□□□ -2.01
UFE1P41834 TRM82YDR165W 1335 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YDL050CYDL050C 372 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YDL158CYDL158C 309 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 ARF1YDL192W 546 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 AIM11YER093C-A 414 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 BTN2YGR142W 1233 nt2.48□□□□□ -2.01
UFE1P41834 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75 ms