Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX2P40425 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX2P40425 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX2P40425 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PBX2P40425 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms