Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRLP40313 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRLP40313 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms