Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FDFT1P37268 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FDFT1P37268 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms