Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLC1P35663 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLC1P35663 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms