Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA3P32297 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms