Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPOP30536 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPOP30536 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms