Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC25CP30307 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC25CP30307 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms