Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CRABP1P29762 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CRABP1P29762 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms