Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARID4AP29374 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID4AP29374 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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