Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJB2P29033 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJB2P29033 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJB2P29033 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJB2P29033 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJB2P29033 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB2P29033 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB2P29033 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms