Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLD1P28340 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLD1P28340 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLD1P28340 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLD1P28340 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLD1P28340 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
POLD1P28340 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLD1P28340 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms