Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PSMB9P28065 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms