Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MARK3P27448 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MARK3P27448 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MARK3P27448 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MARK3P27448 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARK3P27448 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms