Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTFRP26992 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms