Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMA3P25788 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMA3P25788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms