Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYF6P23409 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MYF6P23409 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MYF6P23409 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYF6P23409 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYF6P23409 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYF6P23409 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYF6P23409 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MYF6P23409 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYF6P23409 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms