Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCP2P22307 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCP2P22307 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCP2P22307 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCP2P22307 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCP2P22307 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCP2P22307 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCP2P22307 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms