Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT1P21579 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT1P21579 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT1P21579 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT1P21579 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT1P21579 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYT1P21579 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYT1P21579 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYT1P21579 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT1P21579 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms