Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5AP20339 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5AP20339 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms