Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3BP20337 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3BP20337 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms