Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGCP20142 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGCP20142 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGCP20142 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGCP20142 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGCP20142 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGCP20142 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGCP20142 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PGCP20142 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGCP20142 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGCP20142 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGCP20142 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGCP20142 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms