Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI1P19237 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI1P19237 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms