Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XBP1P17861 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XBP1P17861 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XBP1P17861 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XBP1P17861 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XBP1P17861 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XBP1P17861 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms